Обновляйте сайт с нужной частотой так, как будто копируете файлы из папки в папку на одном компьютере!
Для поддержки сайта совершенно необходимо ПО для работы с FTP, однако, судя по всему, не все существующие инструменты для работы с FTP рассчитаны на частую загрузку файлов на сервер. И действительно - не всегда они настолько удобны, насколько могли бы или даже должны быть. Вообще складывается впечатление, что все они клоны одной программы. Как правило, загрузка файлов на север - это повторяющийся и утомительный процесс, и забот с ним больше, чем он того заслуживает. Тем не менее, всё не так плохо, поскольку с программой FTP Disk этот процесс становится гораздо проще.